מושב נטור, שוכן בדרום רמת הגולן מעל מצוקי נחל סמך ונחל אל-על, ואל מול העיר העתיקה גמלא.
נטור הינו מושב בו חיים תושבים חילונים ודתיים, בעלי השקפות שונות, ואורחות חיים שונים.
המושב רואה עצמו כנושא דגל למען אחדות ישראל וליצירת תרבות יהודית רלוונטית עבור זרמי העם השונים.
המדרשה תקום בשטח שמצפון לשטחי המושב נטור ושם יוקם מרכז לימוד, יצירה ועשיה, בתחומי היהדות, ברוח פתוחה ופלורליסטית.
קהילת נטור מהווה מודל לחיקוי עבור תלמידי מרכז זה, והקשר עם הקהילה בנטור מהווה מרכיב משמעותי וערכי בהקמת המדרשה.